Vào năm 11 tuổi nỗi kinh hoàng trong ước mơ của Lionel xuất hiện, anh mắc phải căn bệnh thiếu hormone tăng trưởng. Tuy nhiên tài năng nhí đã được Carles Rexach, giám đốc thể thao của CLB Barcelona đồng ý trả tiền viện phí và lo công ăn việc làm cho gia đình Messi. Điều kiện đưa ra là  anh chuyển sang Tây Ban Nha để thi đấu cho đội bóng trẻ của họ.